Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms