Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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