Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Usp39Q3TIX9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Usp39Q3TIX9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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