Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2afvQ3THW5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms