Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms