Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo3bQ1EG27 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo3bQ1EG27 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo3bQ1EG27 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo3bQ1EG27 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Myo3bQ1EG27 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Myo3bQ1EG27 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Myo3bQ1EG27 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Myo3bQ1EG27 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Myo3bQ1EG27 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Myo3bQ1EG27 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Myo3bQ1EG27 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Myo3bQ1EG27 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Myo3bQ1EG27 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Myo3bQ1EG27 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Myo3bQ1EG27 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Myo3bQ1EG27 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Myo3bQ1EG27 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myo3bQ1EG27 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms