Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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Rpusd2Q149F1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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Rpusd2Q149F1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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Rpusd2Q149F1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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Rpusd2Q149F1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms