Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ttc39dQ0VF76 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc39dQ0VF76 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms