Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Itgb8Q0VBD0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Itgb8Q0VBD0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Itgb8Q0VBD0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Itgb8Q0VBD0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Itgb8Q0VBD0 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Itgb8Q0VBD0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Itgb8Q0VBD0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Itgb8Q0VBD0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Itgb8Q0VBD0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Itgb8Q0VBD0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Itgb8Q0VBD0 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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