Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zc3h18Q0P678 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms