Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Spata18Q0P557 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spata18Q0P557 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms