Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms