Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TrioQ0KL02 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms