Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf541Q0GGX2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf541Q0GGX2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf541Q0GGX2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf541Q0GGX2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf541Q0GGX2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf541Q0GGX2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf541Q0GGX2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf541Q0GGX2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf541Q0GGX2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf541Q0GGX2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf541Q0GGX2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf541Q0GGX2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf541Q0GGX2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf541Q0GGX2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf541Q0GGX2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf541Q0GGX2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf541Q0GGX2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf541Q0GGX2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf541Q0GGX2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf541Q0GGX2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf541Q0GGX2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf541Q0GGX2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf541Q0GGX2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms