Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

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Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Cass4Q08EC4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Cass4Q08EC4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Cass4Q08EC4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Cass4Q08EC4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Cass4Q08EC4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cass4Q08EC4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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