Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q08AU9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q08AU9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q08AU9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q08AU9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q08AU9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q08AU9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q08AU9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q08AU9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q08AU9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q08AU9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q08AU9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q08AU9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q08AU9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q08AU9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q08AU9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q08AU9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q08AU9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q08AU9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q08AU9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Q08AU9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Q08AU9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q08AU9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q08AU9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q08AU9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q08AU9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q08AU9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q08AU9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q08AU9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q08AU9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q08AU9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q08AU9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q08AU9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q08AU9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q08AU9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q08AU9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q08AU9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q08AU9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q08AU9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q08AU9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q08AU9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q08AU9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q08AU9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q08AU9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q08AU9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q08AU9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q08AU9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q08AU9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q08AU9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q08AU9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q08AU9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Q08AU9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Q08AU9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q08AU9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q08AU9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q08AU9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q08AU9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q08AU9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q08AU9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q08AU9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q08AU9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q08AU9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q08AU9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q08AU9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q08AU9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q08AU9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q08AU9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q08AU9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q08AU9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q08AU9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q08AU9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q08AU9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q08AU9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q08AU9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q08AU9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q08AU9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q08AU9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q08AU9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q08AU9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q08AU9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q08AU9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q08AU9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q08AU9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q08AU9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q08AU9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Q08AU9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q08AU9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q08AU9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q08AU9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q08AU9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q08AU9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Q08AU9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Q08AU9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Q08AU9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q08AU9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q08AU9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q08AU9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q08AU9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q08AU9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q08AU9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms