Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms