Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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