Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms