Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NrepQ07475 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
NrepQ07475 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
NrepQ07475 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NrepQ07475 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms