Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gdf3Q07104 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gdf3Q07104 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gdf3Q07104 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Gdf3Q07104 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Gdf3Q07104 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Gdf3Q07104 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gdf3Q07104 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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