Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms