Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms