Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1Q04750 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1Q04750 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1Q04750 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1Q04750 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1Q04750 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1Q04750 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1Q04750 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1Q04750 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1Q04750 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1Q04750 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top1Q04750 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top1Q04750 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms