Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms