Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Nf1Q04690 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms