Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Muc1Q02496 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms