Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms