Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RykQ01887 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RykQ01887 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RykQ01887 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RykQ01887 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RykQ01887 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RykQ01887 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RykQ01887 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RykQ01887 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RykQ01887 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RykQ01887 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RykQ01887 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RykQ01887 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RykQ01887 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RykQ01887 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RykQ01887 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RykQ01887 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RykQ01887 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RykQ01887 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RykQ01887 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RykQ01887 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RykQ01887 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RykQ01887 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RykQ01887 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RykQ01887 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RykQ01887 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RykQ01887 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RykQ01887 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RykQ01887 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RykQ01887 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RykQ01887 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RykQ01887 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RykQ01887 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RykQ01887 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RykQ01887 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RykQ01887 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RykQ01887 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RykQ01887 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RykQ01887 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RykQ01887 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RykQ01887 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RykQ01887 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RykQ01887 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RykQ01887 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RykQ01887 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RykQ01887 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RykQ01887 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RykQ01887 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RykQ01887 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RykQ01887 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RykQ01887 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RykQ01887 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RykQ01887 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RykQ01887 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RykQ01887 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RykQ01887 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RykQ01887 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RykQ01887 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RykQ01887 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RykQ01887 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RykQ01887 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RykQ01887 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RykQ01887 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RykQ01887 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RykQ01887 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RykQ01887 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RykQ01887 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RykQ01887 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RykQ01887 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RykQ01887 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RykQ01887 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RykQ01887 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RykQ01887 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RykQ01887 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RykQ01887 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RykQ01887 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RykQ01887 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RykQ01887 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RykQ01887 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RykQ01887 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RykQ01887 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RykQ01887 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RykQ01887 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RykQ01887 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RykQ01887 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RykQ01887 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RykQ01887 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
RykQ01887 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RykQ01887 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RykQ01887 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RykQ01887 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RykQ01887 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RykQ01887 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RykQ01887 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RykQ01887 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
RykQ01887 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RykQ01887 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RykQ01887 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RykQ01887 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
RykQ01887 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms