Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VcpQ01853 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VcpQ01853 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VcpQ01853 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VcpQ01853 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VcpQ01853 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VcpQ01853 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VcpQ01853 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VcpQ01853 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VcpQ01853 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms