Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HmgcrQ01237 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms