Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms