Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms