Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabpb1Q00420 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms