Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pax8Q00288 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms