Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx2Q00262 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx2Q00262 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx2Q00262 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx2Q00262 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx2Q00262 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx2Q00262 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx2Q00262 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx2Q00262 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx2Q00262 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx2Q00262 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx2Q00262 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx2Q00262 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx2Q00262 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx2Q00262 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx2Q00262 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx2Q00262 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx2Q00262 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx2Q00262 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx2Q00262 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx2Q00262 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx2Q00262 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx2Q00262 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx2Q00262 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx2Q00262 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx2Q00262 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx2Q00262 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx2Q00262 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx2Q00262 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx2Q00262 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx2Q00262 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx2Q00262 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx2Q00262 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx2Q00262 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx2Q00262 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx2Q00262 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx2Q00262 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx2Q00262 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx2Q00262 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx2Q00262 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx2Q00262 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx2Q00262 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx2Q00262 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms