Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms