Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas2P97460 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas2P97460 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas2P97460 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas2P97460 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas2P97460 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas2P97460 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas2P97460 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas2P97460 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas2P97460 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms