Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms