Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps45P97390 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps45P97390 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps45P97390 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps45P97390 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps45P97390 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps45P97390 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps45P97390 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps45P97390 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps45P97390 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps45P97390 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps45P97390 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps45P97390 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps45P97390 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms