Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhodP97348 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhodP97348 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhodP97348 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhodP97348 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhodP97348 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhodP97348 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhodP97348 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhodP97348 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhodP97348 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhodP97348 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhodP97348 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhodP97348 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhodP97348 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhodP97348 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhodP97348 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhodP97348 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhodP97348 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhodP97348 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhodP97348 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhodP97348 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhodP97348 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhodP97348 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhodP97348 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhodP97348 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhodP97348 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhodP97348 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhodP97348 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RhodP97348 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RhodP97348 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhodP97348 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RhodP97348 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RhodP97348 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhodP97348 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RhodP97348 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RhodP97348 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhodP97348 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhodP97348 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RhodP97348 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhodP97348 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhodP97348 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhodP97348 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhodP97348 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhodP97348 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhodP97348 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RhodP97348 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhodP97348 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhodP97348 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhodP97348 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhodP97348 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhodP97348 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhodP97348 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhodP97348 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhodP97348 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RhodP97348 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhodP97348 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhodP97348 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhodP97348 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RhodP97348 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhodP97348 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhodP97348 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhodP97348 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhodP97348 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhodP97348 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhodP97348 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhodP97348 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhodP97348 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhodP97348 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhodP97348 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhodP97348 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RhodP97348 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RhodP97348 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RhodP97348 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhodP97348 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhodP97348 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhodP97348 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhodP97348 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhodP97348 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhodP97348 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhodP97348 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhodP97348 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhodP97348 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhodP97348 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RhodP97348 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RhodP97348 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhodP97348 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhodP97348 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhodP97348 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RhodP97348 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RhodP97348 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RhodP97348 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RhodP97348 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RhodP97348 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RhodP97348 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RhodP97348 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RhodP97348 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RhodP97348 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RhodP97348 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RhodP97348 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RhodP97348 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms