Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcgP82348 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcgP82348 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcgP82348 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcgP82348 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcgP82348 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcgP82348 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcgP82348 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgcgP82348 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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