Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx1P81068 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx1P81068 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx1P81068 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx1P81068 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx1P81068 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx1P81068 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx1P81068 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx1P81068 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx1P81068 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms