Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Otx1P80205 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Otx1P80205 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Otx1P80205 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Otx1P80205 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Otx1P80205 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Otx1P80205 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Otx1P80205 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Otx1P80205 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Otx1P80205 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Otx1P80205 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Otx1P80205 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Otx1P80205 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Otx1P80205 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms