Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ldb1P70662 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ldb1P70662 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ldb1P70662 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ldb1P70662 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ldb1P70662 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ldb1P70662 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ldb1P70662 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ldb1P70662 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ldb1P70662 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ldb1P70662 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ldb1P70662 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ldb1P70662 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ldb1P70662 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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