Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeboxP70368 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeboxP70368 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeboxP70368 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms