Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Hoxd13P70217 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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Hoxd13P70217 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Hoxd13P70217 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Hoxd13P70217 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Hoxd13P70217 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Hoxd13P70217 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Hoxd13P70217 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Hoxd13P70217 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Hoxd13P70217 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Hoxd13P70217 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Hoxd13P70217 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Hoxd13P70217 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Hoxd13P70217 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Hoxd13P70217 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd13P70217 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Hoxd13P70217 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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