Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plxna3P70208 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms