Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SbdsP70122 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SbdsP70122 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SbdsP70122 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SbdsP70122 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SbdsP70122 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SbdsP70122 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SbdsP70122 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms