Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms